MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011263	CAA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
2	NC_011263	TAAG	2	8	204	211	50 %	25 %	25 %	0 %	203288466
3	NC_011263	TAAAT	2	10	268	277	60 %	40 %	0 %	0 %	203288466
4	NC_011263	AAC	3	9	280	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288466
5	NC_011263	GAA	2	6	302	307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288466
6	NC_011263	TC	3	6	308	313	0 %	50 %	0 %	50 %	203288466
7	NC_011263	TAA	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
8	NC_011263	TTTA	2	8	337	344	25 %	75 %	0 %	0 %	203288466
9	NC_011263	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288466
10	NC_011263	CT	4	8	377	384	0 %	50 %	0 %	50 %	203288466
11	NC_011263	TA	3	6	414	419	50 %	50 %	0 %	0 %	203288466
12	NC_011263	CTA	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288466
13	NC_011263	CAAA	2	8	445	452	75 %	0 %	0 %	25 %	203288466
14	NC_011263	T	9	9	494	502	0 %	100 %	0 %	0 %	203288466
15	NC_011263	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288466
16	NC_011263	TCC	2	6	569	574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288466
17	NC_011263	CTTT	2	8	602	609	0 %	75 %	0 %	25 %	203288466
18	NC_011263	CCTAC	2	10	641	650	20 %	20 %	0 %	60 %	203288466
19	NC_011263	ATTTC	2	10	675	684	20 %	60 %	0 %	20 %	203288466
20	NC_011263	GTAA	2	8	828	835	50 %	25 %	25 %	0 %	203288467
21	NC_011263	T	6	6	839	844	0 %	100 %	0 %	0 %	203288467
22	NC_011263	AGC	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288467
23	NC_011263	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288467
24	NC_011263	A	7	7	908	914	100 %	0 %	0 %	0 %	203288467
25	NC_011263	T	7	7	918	924	0 %	100 %	0 %	0 %	203288467
26	NC_011263	TTC	2	6	936	941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
27	NC_011263	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
28	NC_011263	TAA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
29	NC_011263	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288467
30	NC_011263	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288467
31	NC_011263	ATC	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
32	NC_011263	TAA	2	6	1097	1102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
33	NC_011263	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
34	NC_011263	ATCA	2	8	1128	1135	50 %	25 %	0 %	25 %	203288467
35	NC_011263	AT	3	6	1136	1141	50 %	50 %	0 %	0 %	203288467
36	NC_011263	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288467
37	NC_011263	AAT	2	6	1197	1202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288467
38	NC_011263	ATC	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288467
39	NC_011263	T	6	6	1290	1295	0 %	100 %	0 %	0 %	203288467
40	NC_011263	ATATT	2	10	1315	1324	40 %	60 %	0 %	0 %	203288467
41	NC_011263	AAGG	2	8	1352	1359	50 %	0 %	50 %	0 %	203288467
42	NC_011263	AAG	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
43	NC_011263	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	203288467
44	NC_011263	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288467
45	NC_011263	ATT	2	6	1441	1446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
46	NC_011263	ATT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288467
47	NC_011263	TA	3	6	2264	2269	50 %	50 %	0 %	0 %	203288468
48	NC_011263	TAAA	2	8	2333	2340	75 %	25 %	0 %	0 %	203288468
49	NC_011263	CAA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
50	NC_011263	TTAAT	2	10	2372	2381	40 %	60 %	0 %	0 %	203288468
51	NC_011263	A	7	7	2394	2400	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
52	NC_011263	CAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288468
53	NC_011263	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
54	NC_011263	AT	3	6	2520	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	203288468
55	NC_011263	A	8	8	2530	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
56	NC_011263	AGA	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
57	NC_011263	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288468
58	NC_011263	A	6	6	2588	2593	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
59	NC_011263	TA	4	8	2604	2611	50 %	50 %	0 %	0 %	203288468
60	NC_011263	AGA	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288468
61	NC_011263	A	7	7	2633	2639	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
62	NC_011263	A	6	6	2652	2657	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
63	NC_011263	A	6	6	2664	2669	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468
64	NC_011263	TAG	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288468
65	NC_011263	TA	3	6	2678	2683	50 %	50 %	0 %	0 %	203288468
66	NC_011263	TA	4	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	203288468
67	NC_011263	ATA	3	9	2693	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
68	NC_011263	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288468
69	NC_011263	ACA	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
70	NC_011263	ACA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288468
71	NC_011263	A	8	8	2765	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	203288468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.